Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms