Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp5Q9JKD3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp5Q9JKD3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp5Q9JKD3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms