Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msgn1Q9JK54 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms