Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp2r3cQ9JK24 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r3cQ9JK24 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r3cQ9JK24 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms