Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Tuba8Q9JJZ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tuba8Q9JJZ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tuba8Q9JJZ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tuba8Q9JJZ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Tuba8Q9JJZ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms