Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc86Q9JJ89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms