Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FliiQ9JJ28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FliiQ9JJ28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FliiQ9JJ28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FliiQ9JJ28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms