Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prmt1Q9JIF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt1Q9JIF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt1Q9JIF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt1Q9JIF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt1Q9JIF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prmt1Q9JIF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 413 ms