Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MkksQ9JI70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MkksQ9JI70 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MkksQ9JI70 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MkksQ9JI70 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MkksQ9JI70 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms