Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkc1Q9ESX5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms