Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST1

Gsdma, Gasdermin-A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmaQ9EST1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GsdmaQ9EST1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GsdmaQ9EST1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GsdmaQ9EST1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GsdmaQ9EST1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms