Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DysfQ9ESD7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DysfQ9ESD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DysfQ9ESD7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms