Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ush1cQ9ES64 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ush1cQ9ES64 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms