Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim54Q9ERP3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim54Q9ERP3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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