Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk4Q9ERK0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms