Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Scn4aQ9ER60 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Scn4aQ9ER60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Scn4aQ9ER60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Scn4aQ9ER60 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scn4aQ9ER60 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scn4aQ9ER60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scn4aQ9ER60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Scn4aQ9ER60 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scn4aQ9ER60 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scn4aQ9ER60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms