Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Ndst4Q9EQW8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Ndst4Q9EQW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Ndst4Q9EQW8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst4Q9EQW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Ndst4Q9EQW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Ndst4Q9EQW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Ndst4Q9EQW8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Ndst4Q9EQW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndst4Q9EQW8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndst4Q9EQW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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