Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ndst3Q9EQH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ndst3Q9EQH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst3Q9EQH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms