Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cpsf1Q9EPU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cpsf1Q9EPU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms