Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl4Q9DCU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl4Q9DCU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl4Q9DCU6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms