Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Syde1Q9DBZ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms