Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd2Q9DBX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Susd2Q9DBX3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd2Q9DBX3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms