Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xrn2Q9DBR1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrn2Q9DBR1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrn2Q9DBR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrn2Q9DBR1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms