Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapaQ9DB05 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapaQ9DB05 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NapaQ9DB05 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapaQ9DB05 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms