Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim23Q9DAL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim23Q9DAL0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms