Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scp2d1Q9DAH1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scp2d1Q9DAH1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms