Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700016D06RikQ9DAA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700016D06RikQ9DAA5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700016D06RikQ9DAA5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
1700016D06RikQ9DAA5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700016D06RikQ9DAA5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700016D06RikQ9DAA5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700016D06RikQ9DAA5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700016D06RikQ9DAA5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
1700016D06RikQ9DAA5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms