Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAA3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAA3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms