Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S3

Rwdd2a, RWD domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2aQ9D9S3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rwdd2aQ9D9S3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd2aQ9D9S3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2aQ9D9S3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms