Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pradc1Q9D9N8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pradc1Q9D9N8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms