Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp12Q9D9M2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms