Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc70Q9D9B0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc70Q9D9B0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc70Q9D9B0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms