Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx5Q9D8U8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx5Q9D8U8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms