Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tvp23bQ9D8T4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms