Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms