Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms