Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Derl3Q9D8K3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Derl3Q9D8K3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms