Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc52a2Q9D8F3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc52a2Q9D8F3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms