Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Jam3Q9D8B7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jam3Q9D8B7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms