Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1Q9D883 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
U2af1Q9D883 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2af1Q9D883 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1Q9D883 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms