Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms