Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Chmp5Q9D7S9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms