Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D7E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D7E4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms