Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a3Q9D6X5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a3Q9D6X5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms