Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sdr42e1Q9D665 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr42e1Q9D665 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms