Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt34Q9D646 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms