Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc130Q9D516 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc130Q9D516 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc130Q9D516 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms