Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl3Q9D4V7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl3Q9D4V7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl3Q9D4V7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms