Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms