Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap53Q9D439 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms